12 мая к.б.н. Д.Г. Алексеев прочтет лекцию "Программирование как метод изучения биологии"

30.04.2016

Лаборатория теоретической и прикладной функциональной геномики и кафедра цитологии и генетики, ФЕН НГУ представляет лекцию к.б.н. Д.Г. Алексеев "Программирование как метод изучения биологии"

Лекция состоится 12 мая в 16:20 по адресу: НГУ, ул. Пирогова 2, ауд. 120а (переход).

Уже 10 лет сотрудники лаборатории и кафедры анализируют большие массивы биологических данных - "омик" (протеомика, геномика, метаболомика, метагеномика, траскриптомика). При этом объем анализируемых данных и получаемой информации непрерывно увеличивается.

Использование принципов объектно-ориентированного программирования при анализе таких данных позволит решить сразу несколько актуальных в биоинформатике проблем. Будет существенно повышена интерпретируемость программного кода, упрощена работа с данными, а так же унифицирован формат самих данных, что даст возможность без труда оперировать данными исследований в различных проектах.

В лекции будут приведены примеры работ лаборатории за последние 10 лет, посвященных изучению метагенома, транскриптома и генома человека.

Алексеев Дмитрий Глебович - к.б.н., выпускник МФТИ 2007 г. С 2005 года занимается биоинорматикой в области анализа омикс данных: протеомика, геномика, транскриптомика, метаболомика. Руководил группой и лабораторией биоинформатики в НИИ ФХМ, автор программы "Введение в биоинформатику" в МФТИ. С 2016 года участвует в работе лаборатории теоретической и прикладной функциональной геномики, ФЕН, НГУ. Автор более 40 научных публикаций. Основные научные интересы - сложные системы, системная биология и микробиота кишечника.