Стипендия имени академика А.И. Мальцева учреждена Сибирским Фондом алгебры и логики и Фондом поддержки ММФ НГУ в честь выдающегося математика, академика, основателя Сибирской школы алгебры и логики Анатолия Ивановича Мальцева с целью поощрения учебной и научно-исследовательской деятельности студентов ММФ НГУ.

Стипендия А.И.Мальцева назначается на конкурсной основе студентам, специализирующихся в области алгебры (одна стипендия) и в области логики (одна стипендия) и имеющие только хорошие и отличные оценки за два предыдущих семестра. Предпочтение отдается студентам, активно участвующим в научно-исследовательской, общественной и спортивной жизни НГУ и г. Новосибирска. Для участия в конкурсе необходимо представление научного руководителя студента по курсовой и дипломной работе с обоснованием назначения на стипендию и характеристикой его учебной и научно-исследовательской деятельности.

Стипендиаты получают соответствующее свидетельство и ежемесячную стипендию в течение одного учебного года с 1 сентября по 30 июня.
C сентября 2012 года стипендия назначается каждый семестр.

На каждый учебный год, начиная с сентября 2004 года установлены две стипендии размером 1750 (одна тысяча семьсот пятьдесят) рублей каждая ежемесячно.
С сентября 2007 года стипендия увеличена до 2500 руб.
C сентября 2012 года размер стипендии увеличен до 3000 рублей ежемесячно.
C сентября 2015 года размер стипендии увеличен до 5000 рублей ежемесячно.

Решение о ее назначении принимается кафедрой "Алгебры и математической логики" и кафедрой "Дискретной математики и информатики".