Кафедра образована в 1987 решением Ученого Совета НГУ от 16.04.1987г. Организатором кафедры и первым ее заведующим был член-корр. РАН В.Е. Котов. С 1998 года кафедрой руководит д.т.н., профессор Б.М. Глинский.
На момент организации кафедры задачей кафедры была подготовка высококвалифицированных специалистов широкого профиля по моделированию, программному обеспечению, архитектуре ЭВМ и вычислительных систем. В настоящее время направленность подготовки студентов изменилась с учетом современных требований к выпускникам.
Классические курсы остались:архитектура ЭВМ; операционные системы, сети ЭВМ и др., однако также появились и новые курсы в соответствии с необходимостью специализации студентов в области высокопроизводительных вычислений с применением кластерных суперЭВМ.
Преподаватели кафедры являются высококвалифицированными специалистами, большинство из них работают в институтах СО РАН.